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單分子RNA FISH,熒光原位雜交新時代

版權所有,轉載請聯系基因市場部
2019-06-28


基因表達研究中,單個細胞的特征常常有別于該群體的平均特征,這樣的細胞異質性已經成為相關研究中不可忽視的現象。因此,近年來能夠實現單分子水平RNA原位檢測的FISH(smFISH)技術備受青睞。它們能夠直觀的實現單個細胞中RNA的定量和亞細胞水平的定位。在諸多可選技術中,Stellaris技術尤為突出!

                             ——LGC Genomics

傳統的原位雜交技術局限于靈敏度、特異性不高,而大部分RNA在細胞中的拷貝數都很少,而且像一些癌癥病人來源的組織穿刺樣本,樣本本身量就特別少,所以高靈敏度的原位雜交技術就顯得尤其重要。So,單細胞單拷貝級別靈敏度的StellarisTM  RNA FISH技術無疑開啟了細胞內定位RNA分子的新時代!

 

What is Stellaris RNA FISH

                         ——2011年 Nature Method



StellarisTM  RNA FISH---完整細胞或組織中的單個RNA分子同時進行檢測、定位和定量的一項技術


Stellaris RNA FISH工作原理

多條相同熒光標記的探針結合到一條RNA靶標上產生一個顯微鏡下肉眼可見的熒光點。

操作簡單,僅需一步雜交,一天內即可完成單分子RNA FISH檢測。


可能有人會問,Stellaris探針如何保證特異性?

更低的假陰性:針對靶標基因設計25-48條探針,這樣的設計方法可以使假陰性降到最低,因為即使有部分mRNA降解或者被結合RNA的蛋白阻礙,仍然還會有大部分充足的探針會結合到靶基因上。

更低的假陽性:只有當10個以上的探針聚集在一起時才能觀測到熒光信號,即使有部分脫靶的探針也會非常弱,也會造成熒光信號的彌散而遠遠低于靶基因的信號。

Custom 或者 DesignReady 探針組

StellarisTM  RNA FISH提供免費的在線探針設計軟件,針對目標RNA 設計最佳的Stellaris RNA FISH 探針組。同時,針對常見RNA序列,我們也提供DesignReady探針組,其經過專業的設計以及嚴格的生物信息學分析以確保其特異性。

在線設計鏈接

在線探針設計軟件

https://www.biosearchtech.com/support/tools/design-software/stellaris-probe-designer

DesignReady探針組,點擊查看您的基因是否是DesignReady!

https://www.biosearchtech.com/products/rna-fish/designready-stellaris-probe-sets


Stellaris RNA FISH單分子熒光原位雜交的優勢

傳統的原位雜交技術除了靈敏度受限,還不能做多重,無法定量,操作上也比較耗時和復雜,Stellaris RNA FISH單分子熒光原位雜交卻很好的解決了這些問題。

靈敏度高:可檢測單細胞、單拷貝RNA分子;

特異性好:多組探針設計,潛在脫靶效應或少數RNA降解可忽略,有效避免假陽性

操作簡單:無抗體抗原結合的繁瑣步驟;一天即可得到結果

適用性廣:無物種限制(植物、動物、微生物等);無樣本限制(細胞、組織、石蠟切片(FFPE)、全組織…);無需特殊儀器與配套試劑

探針設計靈活,熒光標記靈活

多重共定位:多靶點RNA共定位;RNA與蛋白共定位;寡核苷酸探針與其它原位技術兼容性好

應用:轉錄組水平的研究與探索一直是分子領域追逐的熱點,RNA FISH檢測手段是不可缺少的利器,而Stellaris RNA FISH更是提供了全新的單分子熒光原位雜交技術。

1

RNA分子亞細胞定位和定量

2

研究RNA分子的遷移/轉位(如病毒RNA在宿主細胞內的遷移與擴散)

3

研究單細胞之間RNA表達的異質性

4

分析DNA轉錄位點活性

5

研究RNA作用機制:RNA-蛋白相互作用…

Combine Stellaris RNA FISH + IF


StellarisTM RNA FISH出版信息: 

Stellaris RNA FISH技術近年來已得到了越來越多的科研工作者認可,引用的paper超過33%發表于Nature、Science、Cell及其子刊上!

請訪問Citation Center 網站獲取完整的文獻列表信息。

https://www.biosearchtech.com/support/resources/stellaris-citation-center


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